Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFRSF9Q07011 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms