Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPN11Q06124 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN11Q06124 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN11Q06124 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms