Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORDQ00796 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORDQ00796 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORDQ00796 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORDQ00796 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORDQ00796 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORDQ00796 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORDQ00796 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORDQ00796 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORDQ00796 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SORDQ00796 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORDQ00796 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORDQ00796 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SORDQ00796 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORDQ00796 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORDQ00796 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORDQ00796 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORDQ00796 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORDQ00796 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SORDQ00796 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORDQ00796 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORDQ00796 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORDQ00796 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORDQ00796 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORDQ00796 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SORDQ00796 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SORDQ00796 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORDQ00796 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SORDQ00796 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORDQ00796 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORDQ00796 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORDQ00796 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SORDQ00796 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORDQ00796 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORDQ00796 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORDQ00796 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORDQ00796 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SORDQ00796 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORDQ00796 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SORDQ00796 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORDQ00796 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORDQ00796 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SORDQ00796 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORDQ00796 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORDQ00796 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORDQ00796 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORDQ00796 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORDQ00796 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORDQ00796 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SORDQ00796 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORDQ00796 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORDQ00796 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORDQ00796 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORDQ00796 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORDQ00796 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORDQ00796 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORDQ00796 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORDQ00796 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORDQ00796 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SORDQ00796 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORDQ00796 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORDQ00796 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORDQ00796 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORDQ00796 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORDQ00796 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SORDQ00796 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORDQ00796 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORDQ00796 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORDQ00796 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORDQ00796 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORDQ00796 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORDQ00796 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SORDQ00796 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORDQ00796 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SORDQ00796 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORDQ00796 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORDQ00796 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORDQ00796 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORDQ00796 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SORDQ00796 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms