Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2C1P98194 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2C1P98194 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP2C1P98194 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms