Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIM1P81133 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIM1P81133 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIM1P81133 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SIM1P81133 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIM1P81133 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIM1P81133 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIM1P81133 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIM1P81133 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIM1P81133 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIM1P81133 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIM1P81133 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIM1P81133 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIM1P81133 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIM1P81133 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIM1P81133 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIM1P81133 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIM1P81133 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIM1P81133 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIM1P81133 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIM1P81133 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIM1P81133 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIM1P81133 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIM1P81133 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIM1P81133 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIM1P81133 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIM1P81133 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIM1P81133 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIM1P81133 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIM1P81133 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIM1P81133 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIM1P81133 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIM1P81133 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIM1P81133 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIM1P81133 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIM1P81133 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIM1P81133 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIM1P81133 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIM1P81133 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIM1P81133 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIM1P81133 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIM1P81133 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIM1P81133 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIM1P81133 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIM1P81133 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIM1P81133 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIM1P81133 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIM1P81133 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIM1P81133 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIM1P81133 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIM1P81133 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIM1P81133 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIM1P81133 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIM1P81133 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIM1P81133 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIM1P81133 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIM1P81133 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIM1P81133 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIM1P81133 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIM1P81133 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIM1P81133 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIM1P81133 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIM1P81133 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIM1P81133 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIM1P81133 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIM1P81133 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIM1P81133 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIM1P81133 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIM1P81133 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIM1P81133 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIM1P81133 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIM1P81133 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIM1P81133 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIM1P81133 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIM1P81133 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIM1P81133 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIM1P81133 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIM1P81133 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIM1P81133 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIM1P81133 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIM1P81133 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIM1P81133 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIM1P81133 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIM1P81133 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIM1P81133 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIM1P81133 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIM1P81133 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIM1P81133 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIM1P81133 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms