Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCCD1P59942 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCCD1P59942 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms