Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP107P57740 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP107P57740 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP107P57740 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP107P57740 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP107P57740 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP107P57740 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP107P57740 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP107P57740 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP107P57740 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP107P57740 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP107P57740 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP107P57740 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP107P57740 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP107P57740 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP107P57740 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP107P57740 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP107P57740 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP107P57740 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP107P57740 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP107P57740 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP107P57740 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP107P57740 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP107P57740 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP107P57740 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP107P57740 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP107P57740 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP107P57740 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP107P57740 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP107P57740 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP107P57740 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP107P57740 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP107P57740 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP107P57740 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP107P57740 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP107P57740 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP107P57740 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP107P57740 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP107P57740 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP107P57740 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP107P57740 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP107P57740 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP107P57740 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP107P57740 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP107P57740 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP107P57740 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP107P57740 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP107P57740 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP107P57740 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP107P57740 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP107P57740 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP107P57740 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP107P57740 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP107P57740 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP107P57740 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP107P57740 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP107P57740 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP107P57740 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP107P57740 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP107P57740 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP107P57740 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP107P57740 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP107P57740 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP107P57740 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP107P57740 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP107P57740 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP107P57740 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP107P57740 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP107P57740 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP107P57740 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP107P57740 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP107P57740 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP107P57740 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP107P57740 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP107P57740 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP107P57740 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP107P57740 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP107P57740 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP107P57740 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP107P57740 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP107P57740 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP107P57740 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP107P57740 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP107P57740 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP107P57740 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP107P57740 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP107P57740 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP107P57740 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP107P57740 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms