Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAD23AP54725 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAD23AP54725 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAD23AP54725 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms