Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK4P51957 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK4P51957 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK4P51957 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK4P51957 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK4P51957 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK4P51957 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK4P51957 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK4P51957 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK4P51957 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK4P51957 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK4P51957 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK4P51957 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK4P51957 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK4P51957 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK4P51957 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK4P51957 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK4P51957 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEK4P51957 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK4P51957 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK4P51957 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK4P51957 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK4P51957 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK4P51957 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK4P51957 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK4P51957 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK4P51957 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEK4P51957 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEK4P51957 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEK4P51957 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEK4P51957 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEK4P51957 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEK4P51957 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK4P51957 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK4P51957 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK4P51957 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK4P51957 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK4P51957 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEK4P51957 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEK4P51957 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK4P51957 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK4P51957 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK4P51957 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK4P51957 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK4P51957 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK4P51957 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK4P51957 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEK4P51957 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK4P51957 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK4P51957 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK4P51957 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK4P51957 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK4P51957 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK4P51957 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEK4P51957 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK4P51957 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK4P51957 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK4P51957 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK4P51957 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK4P51957 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK4P51957 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK4P51957 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK4P51957 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK4P51957 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEK4P51957 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK4P51957 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK4P51957 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK4P51957 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK4P51957 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK4P51957 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK4P51957 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEK4P51957 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK4P51957 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK4P51957 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK4P51957 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK4P51957 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK4P51957 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK4P51957 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK4P51957 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK4P51957 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEK4P51957 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK4P51957 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK4P51957 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK4P51957 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK4P51957 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK4P51957 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEK4P51957 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEK4P51957 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK4P51957 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK4P51957 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK4P51957 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK4P51957 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK4P51957 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK4P51957 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK4P51957 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEK4P51957 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK4P51957 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK4P51957 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK4P51957 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK4P51957 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms