Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKN1CP49918 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN1CP49918 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN1CP49918 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms