Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPAP49450 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPAP49450 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPAP49450 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPAP49450 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPAP49450 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPAP49450 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPAP49450 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPAP49450 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPAP49450 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPAP49450 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPAP49450 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPAP49450 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPAP49450 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPAP49450 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPAP49450 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPAP49450 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPAP49450 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPAP49450 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPAP49450 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPAP49450 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPAP49450 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPAP49450 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPAP49450 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPAP49450 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPAP49450 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPAP49450 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPAP49450 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPAP49450 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPAP49450 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPAP49450 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPAP49450 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPAP49450 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPAP49450 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPAP49450 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPAP49450 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPAP49450 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPAP49450 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPAP49450 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPAP49450 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPAP49450 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPAP49450 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPAP49450 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPAP49450 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPAP49450 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPAP49450 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPAP49450 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPAP49450 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPAP49450 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPAP49450 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPAP49450 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPAP49450 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPAP49450 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPAP49450 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPAP49450 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPAP49450 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPAP49450 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CENPAP49450 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPAP49450 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPAP49450 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPAP49450 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPAP49450 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPAP49450 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPAP49450 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPAP49450 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPAP49450 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPAP49450 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPAP49450 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPAP49450 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPAP49450 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPAP49450 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPAP49450 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPAP49450 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPAP49450 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPAP49450 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPAP49450 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPAP49450 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPAP49450 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPAP49450 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPAP49450 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPAP49450 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPAP49450 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPAP49450 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPAP49450 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPAP49450 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms