Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC10P48553 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC10P48553 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC10P48553 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms