Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UTRNP46939 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UTRNP46939 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
UTRNP46939 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UTRNP46939 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UTRNP46939 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UTRNP46939 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UTRNP46939 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UTRNP46939 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UTRNP46939 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
UTRNP46939 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
UTRNP46939 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UTRNP46939 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UTRNP46939 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UTRNP46939 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UTRNP46939 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
UTRNP46939 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UTRNP46939 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UTRNP46939 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UTRNP46939 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UTRNP46939 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UTRNP46939 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UTRNP46939 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UTRNP46939 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
UTRNP46939 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UTRNP46939 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UTRNP46939 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UTRNP46939 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UTRNP46939 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
UTRNP46939 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UTRNP46939 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UTRNP46939 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UTRNP46939 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UTRNP46939 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UTRNP46939 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UTRNP46939 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UTRNP46939 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UTRNP46939 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UTRNP46939 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UTRNP46939 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UTRNP46939 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UTRNP46939 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UTRNP46939 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UTRNP46939 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UTRNP46939 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UTRNP46939 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UTRNP46939 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UTRNP46939 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UTRNP46939 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UTRNP46939 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UTRNP46939 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UTRNP46939 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UTRNP46939 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UTRNP46939 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UTRNP46939 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UTRNP46939 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UTRNP46939 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UTRNP46939 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UTRNP46939 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UTRNP46939 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UTRNP46939 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UTRNP46939 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UTRNP46939 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UTRNP46939 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UTRNP46939 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UTRNP46939 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UTRNP46939 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UTRNP46939 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UTRNP46939 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
UTRNP46939 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
UTRNP46939 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UTRNP46939 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UTRNP46939 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UTRNP46939 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
UTRNP46939 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UTRNP46939 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
UTRNP46939 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UTRNP46939 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UTRNP46939 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UTRNP46939 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UTRNP46939 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UTRNP46939 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UTRNP46939 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
UTRNP46939 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UTRNP46939 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UTRNP46939 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UTRNP46939 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UTRNP46939 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UTRNP46939 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UTRNP46939 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UTRNP46939 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UTRNP46939 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UTRNP46939 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UTRNP46939 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UTRNP46939 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UTRNP46939 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UTRNP46939 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
UTRNP46939 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
UTRNP46939 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UTRNP46939 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms