Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIA3P42263 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA3P42263 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.6 ms