Protein–RNA interactions for Protein: P41597

CCR2, C-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR2P41597 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCR2P41597 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR2P41597 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR2P41597 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR2P41597 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR2P41597 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR2P41597 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR2P41597 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR2P41597 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR2P41597 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR2P41597 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR2P41597 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR2P41597 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR2P41597 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR2P41597 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR2P41597 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR2P41597 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR2P41597 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR2P41597 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR2P41597 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR2P41597 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR2P41597 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR2P41597 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR2P41597 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR2P41597 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR2P41597 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR2P41597 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR2P41597 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR2P41597 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR2P41597 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR2P41597 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR2P41597 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR2P41597 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCR2P41597 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR2P41597 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCR2P41597 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR2P41597 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR2P41597 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR2P41597 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR2P41597 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR2P41597 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR2P41597 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR2P41597 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR2P41597 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR2P41597 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR2P41597 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR2P41597 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR2P41597 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR2P41597 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR2P41597 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR2P41597 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR2P41597 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR2P41597 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR2P41597 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR2P41597 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR2P41597 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR2P41597 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR2P41597 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR2P41597 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR2P41597 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR2P41597 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR2P41597 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR2P41597 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR2P41597 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCR2P41597 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR2P41597 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR2P41597 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR2P41597 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR2P41597 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR2P41597 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR2P41597 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR2P41597 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR2P41597 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR2P41597 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR2P41597 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR2P41597 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR2P41597 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR2P41597 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR2P41597 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR2P41597 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR2P41597 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR2P41597 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR2P41597 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR2P41597 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR2P41597 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR2P41597 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR2P41597 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR2P41597 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR2P41597 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms