Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNFP41002 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNFP41002 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNFP41002 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNFP41002 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNFP41002 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNFP41002 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNFP41002 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNFP41002 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNFP41002 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNFP41002 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNFP41002 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNFP41002 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNFP41002 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNFP41002 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNFP41002 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNFP41002 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNFP41002 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNFP41002 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNFP41002 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNFP41002 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNFP41002 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNFP41002 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNFP41002 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNFP41002 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNFP41002 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNFP41002 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNFP41002 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNFP41002 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNFP41002 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNFP41002 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNFP41002 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNFP41002 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNFP41002 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNFP41002 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNFP41002 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNFP41002 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNFP41002 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNFP41002 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNFP41002 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNFP41002 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNFP41002 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNFP41002 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNFP41002 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNFP41002 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNFP41002 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNFP41002 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNFP41002 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNFP41002 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNFP41002 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNFP41002 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNFP41002 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNFP41002 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNFP41002 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNFP41002 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNFP41002 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNFP41002 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNFP41002 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNFP41002 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNFP41002 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNFP41002 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNFP41002 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNFP41002 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNFP41002 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNFP41002 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNFP41002 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNFP41002 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNFP41002 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNFP41002 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNFP41002 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNFP41002 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNFP41002 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNFP41002 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNFP41002 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNFP41002 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNFP41002 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNFP41002 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNFP41002 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNFP41002 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNFP41002 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNFP41002 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNFP41002 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNFP41002 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNFP41002 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNFP41002 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNFP41002 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNFP41002 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNFP41002 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNFP41002 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNFP41002 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms