Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGAEP38570 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ITGAEP38570 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ITGAEP38570 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ITGAEP38570 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms