Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VDAC1P21796 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VDAC1P21796 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms