Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRM3P20309 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM3P20309 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms