Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLUP10909 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLUP10909 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLUP10909 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLUP10909 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLUP10909 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLUP10909 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLUP10909 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLUP10909 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLUP10909 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLUP10909 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLUP10909 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLUP10909 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLUP10909 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CLUP10909 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLUP10909 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLUP10909 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLUP10909 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLUP10909 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLUP10909 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLUP10909 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLUP10909 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLUP10909 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLUP10909 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLUP10909 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLUP10909 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLUP10909 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLUP10909 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLUP10909 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLUP10909 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLUP10909 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLUP10909 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLUP10909 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLUP10909 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLUP10909 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLUP10909 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLUP10909 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLUP10909 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLUP10909 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLUP10909 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLUP10909 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLUP10909 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLUP10909 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLUP10909 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLUP10909 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLUP10909 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLUP10909 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLUP10909 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLUP10909 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLUP10909 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLUP10909 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLUP10909 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLUP10909 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLUP10909 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLUP10909 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLUP10909 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLUP10909 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLUP10909 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLUP10909 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLUP10909 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLUP10909 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLUP10909 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLUP10909 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLUP10909 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLUP10909 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLUP10909 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLUP10909 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLUP10909 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLUP10909 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLUP10909 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLUP10909 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLUP10909 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLUP10909 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLUP10909 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms