Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GLI2P10070 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GLI2P10070 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
GLI2P10070 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
GLI2P10070 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
GLI2P10070 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GLI2P10070 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GLI2P10070 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GLI2P10070 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GLI2P10070 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
GLI2P10070 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GLI2P10070 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GLI2P10070 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
GLI2P10070 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GLI2P10070 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GLI2P10070 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GLI2P10070 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
GLI2P10070 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
GLI2P10070 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
GLI2P10070 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GLI2P10070 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GLI2P10070 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GLI2P10070 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GLI2P10070 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GLI2P10070 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
GLI2P10070 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GLI2P10070 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GLI2P10070 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GLI2P10070 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GLI2P10070 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GLI2P10070 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
GLI2P10070 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
GLI2P10070 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
GLI2P10070 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
GLI2P10070 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GLI2P10070 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GLI2P10070 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GLI2P10070 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GLI2P10070 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GLI2P10070 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GLI2P10070 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GLI2P10070 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GLI2P10070 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
GLI2P10070 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GLI2P10070 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GLI2P10070 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
GLI2P10070 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
GLI2P10070 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GLI2P10070 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GLI2P10070 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GLI2P10070 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GLI2P10070 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GLI2P10070 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
GLI2P10070 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GLI2P10070 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
GLI2P10070 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GLI2P10070 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GLI2P10070 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GLI2P10070 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GLI2P10070 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
GLI2P10070 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GLI2P10070 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GLI2P10070 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GLI2P10070 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GLI2P10070 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GLI2P10070 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GLI2P10070 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GLI2P10070 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GLI2P10070 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GLI2P10070 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
GLI2P10070 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GLI2P10070 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
GLI2P10070 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GLI2P10070 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GLI2P10070 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GLI2P10070 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
GLI2P10070 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GLI2P10070 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GLI2P10070 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GLI2P10070 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GLI2P10070 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
GLI2P10070 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GLI2P10070 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GLI2P10070 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GLI2P10070 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
GLI2P10070 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GLI2P10070 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GLI2P10070 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GLI2P10070 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GLI2P10070 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GLI2P10070 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GLI2P10070 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
GLI2P10070 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
GLI2P10070 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
GLI2P10070 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GLI2P10070 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GLI2P10070 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GLI2P10070 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GLI2P10070 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
GLI2P10070 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms