Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGRP06401 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGRP06401 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGRP06401 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGRP06401 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGRP06401 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGRP06401 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGRP06401 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGRP06401 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGRP06401 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGRP06401 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGRP06401 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGRP06401 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGRP06401 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PGRP06401 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGRP06401 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGRP06401 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGRP06401 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGRP06401 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGRP06401 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGRP06401 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGRP06401 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGRP06401 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGRP06401 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGRP06401 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGRP06401 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGRP06401 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGRP06401 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGRP06401 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGRP06401 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGRP06401 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGRP06401 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGRP06401 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGRP06401 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGRP06401 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGRP06401 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGRP06401 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGRP06401 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGRP06401 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PGRP06401 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGRP06401 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGRP06401 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGRP06401 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGRP06401 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGRP06401 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGRP06401 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGRP06401 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGRP06401 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGRP06401 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGRP06401 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGRP06401 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGRP06401 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGRP06401 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGRP06401 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGRP06401 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGRP06401 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGRP06401 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGRP06401 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGRP06401 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGRP06401 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGRP06401 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGRP06401 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGRP06401 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms