Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1P04632 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1P04632 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms