Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF2P04141 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF2P04141 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF2P04141 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF2P04141 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF2P04141 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF2P04141 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF2P04141 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF2P04141 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF2P04141 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF2P04141 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF2P04141 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF2P04141 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF2P04141 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF2P04141 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF2P04141 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF2P04141 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF2P04141 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2P04141 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2P04141 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2P04141 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2P04141 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2P04141 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF2P04141 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2P04141 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2P04141 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2P04141 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2P04141 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF2P04141 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2P04141 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2P04141 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2P04141 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2P04141 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF2P04141 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2P04141 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2P04141 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2P04141 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2P04141 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2P04141 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF2P04141 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2P04141 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2P04141 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2P04141 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2P04141 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2P04141 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2P04141 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2P04141 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF2P04141 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2P04141 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2P04141 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2P04141 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2P04141 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF2P04141 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2P04141 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2P04141 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2P04141 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2P04141 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF2P04141 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF2P04141 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF2P04141 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2P04141 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2P04141 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2P04141 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF2P04141 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2P04141 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2P04141 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2P04141 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2P04141 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2P04141 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF2P04141 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2P04141 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2P04141 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2P04141 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2P04141 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2P04141 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2P04141 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2P04141 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2P04141 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2P04141 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF2P04141 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2P04141 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2P04141 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2P04141 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2P04141 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2P04141 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2P04141 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2P04141 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF2P04141 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms