Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOEP02649 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOEP02649 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOEP02649 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOEP02649 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOEP02649 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOEP02649 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOEP02649 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOEP02649 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOEP02649 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOEP02649 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOEP02649 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOEP02649 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOEP02649 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOEP02649 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOEP02649 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOEP02649 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOEP02649 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOEP02649 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOEP02649 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOEP02649 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOEP02649 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOEP02649 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOEP02649 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOEP02649 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APOEP02649 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOEP02649 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOEP02649 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOEP02649 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APOEP02649 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOEP02649 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOEP02649 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOEP02649 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOEP02649 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOEP02649 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOEP02649 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOEP02649 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOEP02649 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOEP02649 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOEP02649 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOEP02649 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOEP02649 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOEP02649 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOEP02649 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOEP02649 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOEP02649 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOEP02649 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOEP02649 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOEP02649 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOEP02649 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOEP02649 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOEP02649 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOEP02649 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOEP02649 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOEP02649 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOEP02649 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOEP02649 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOEP02649 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOEP02649 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOEP02649 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOEP02649 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOEP02649 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOEP02649 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOEP02649 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOEP02649 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOEP02649 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOEP02649 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOEP02649 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOEP02649 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOEP02649 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOEP02649 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOEP02649 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOEP02649 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOEP02649 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOEP02649 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOEP02649 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOEP02649 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOEP02649 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOEP02649 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APOEP02649 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOEP02649 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOEP02649 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOEP02649 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOEP02649 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APOEP02649 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOEP02649 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOEP02649 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOEP02649 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOEP02649 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOEP02649 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOEP02649 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOEP02649 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOEP02649 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APOEP02649 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOEP02649 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOEP02649 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOEP02649 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APOEP02649 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOEP02649 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOEP02649 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms