Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-AP01891 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HLA-AP01891 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms