Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB6O95452 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB6O95452 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB6O95452 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB6O95452 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB6O95452 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB6O95452 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB6O95452 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GJB6O95452 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB6O95452 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB6O95452 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB6O95452 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB6O95452 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB6O95452 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB6O95452 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB6O95452 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB6O95452 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB6O95452 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB6O95452 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB6O95452 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB6O95452 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB6O95452 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB6O95452 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB6O95452 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB6O95452 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB6O95452 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB6O95452 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB6O95452 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB6O95452 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB6O95452 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB6O95452 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB6O95452 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB6O95452 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB6O95452 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB6O95452 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB6O95452 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB6O95452 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB6O95452 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB6O95452 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB6O95452 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB6O95452 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB6O95452 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB6O95452 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB6O95452 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB6O95452 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB6O95452 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB6O95452 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB6O95452 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB6O95452 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB6O95452 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB6O95452 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB6O95452 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB6O95452 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB6O95452 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB6O95452 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB6O95452 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB6O95452 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB6O95452 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB6O95452 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB6O95452 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB6O95452 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB6O95452 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB6O95452 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB6O95452 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB6O95452 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB6O95452 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB6O95452 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB6O95452 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB6O95452 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB6O95452 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB6O95452 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB6O95452 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB6O95452 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB6O95452 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB6O95452 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB6O95452 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB6O95452 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB6O95452 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB6O95452 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB6O95452 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB6O95452 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB6O95452 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB6O95452 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB6O95452 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB6O95452 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB6O95452 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB6O95452 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB6O95452 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB6O95452 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB6O95452 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms