Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX3O95343 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX3O95343 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX3O95343 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX3O95343 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX3O95343 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX3O95343 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX3O95343 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX3O95343 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX3O95343 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX3O95343 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX3O95343 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX3O95343 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX3O95343 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX3O95343 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX3O95343 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX3O95343 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX3O95343 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX3O95343 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX3O95343 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX3O95343 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX3O95343 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIX3O95343 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIX3O95343 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIX3O95343 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIX3O95343 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIX3O95343 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIX3O95343 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIX3O95343 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIX3O95343 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX3O95343 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX3O95343 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX3O95343 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX3O95343 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX3O95343 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX3O95343 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX3O95343 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX3O95343 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX3O95343 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX3O95343 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX3O95343 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX3O95343 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX3O95343 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX3O95343 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX3O95343 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX3O95343 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX3O95343 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX3O95343 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX3O95343 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX3O95343 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX3O95343 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX3O95343 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX3O95343 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX3O95343 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX3O95343 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX3O95343 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX3O95343 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX3O95343 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX3O95343 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX3O95343 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX3O95343 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX3O95343 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX3O95343 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX3O95343 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX3O95343 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX3O95343 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms