Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIOO75962 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIOO75962 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIOO75962 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIOO75962 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIOO75962 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIOO75962 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIOO75962 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIOO75962 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIOO75962 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIOO75962 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIOO75962 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIOO75962 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIOO75962 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIOO75962 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIOO75962 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIOO75962 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIOO75962 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIOO75962 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIOO75962 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIOO75962 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIOO75962 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIOO75962 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIOO75962 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIOO75962 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIOO75962 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIOO75962 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIOO75962 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIOO75962 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIOO75962 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIOO75962 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIOO75962 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIOO75962 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIOO75962 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIOO75962 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIOO75962 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIOO75962 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIOO75962 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIOO75962 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIOO75962 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIOO75962 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIOO75962 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIOO75962 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIOO75962 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIOO75962 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIOO75962 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIOO75962 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIOO75962 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIOO75962 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIOO75962 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIOO75962 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIOO75962 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIOO75962 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIOO75962 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIOO75962 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIOO75962 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIOO75962 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIOO75962 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIOO75962 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIOO75962 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIOO75962 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIOO75962 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIOO75962 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIOO75962 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIOO75962 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIOO75962 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOO75962 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOO75962 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOO75962 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOO75962 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOO75962 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOO75962 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOO75962 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIOO75962 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIOO75962 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIOO75962 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIOO75962 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIOO75962 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOO75962 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIOO75962 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOO75962 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOO75962 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOO75962 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOO75962 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOO75962 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIOO75962 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOO75962 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOO75962 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOO75962 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIOO75962 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms