Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPIPB7O75200 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB7O75200 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB7O75200 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB7O75200 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB7O75200 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB7O75200 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB7O75200 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB7O75200 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB7O75200 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB7O75200 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB7O75200 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB7O75200 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB7O75200 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB7O75200 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB7O75200 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB7O75200 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB7O75200 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB7O75200 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB7O75200 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB7O75200 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB7O75200 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB7O75200 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB7O75200 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB7O75200 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB7O75200 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB7O75200 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB7O75200 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB7O75200 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB7O75200 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB7O75200 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB7O75200 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB7O75200 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB7O75200 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB7O75200 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB7O75200 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB7O75200 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB7O75200 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB7O75200 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB7O75200 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms