Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEMFO60524 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEMFO60524 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEMFO60524 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEMFO60524 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEMFO60524 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEMFO60524 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEMFO60524 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEMFO60524 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEMFO60524 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEMFO60524 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEMFO60524 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEMFO60524 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEMFO60524 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEMFO60524 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEMFO60524 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEMFO60524 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEMFO60524 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEMFO60524 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMFO60524 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMFO60524 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMFO60524 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMFO60524 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMFO60524 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMFO60524 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMFO60524 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMFO60524 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEMFO60524 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEMFO60524 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEMFO60524 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEMFO60524 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEMFO60524 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEMFO60524 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NEMFO60524 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEMFO60524 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEMFO60524 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEMFO60524 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEMFO60524 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEMFO60524 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEMFO60524 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEMFO60524 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMFO60524 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMFO60524 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMFO60524 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMFO60524 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMFO60524 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEMFO60524 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMFO60524 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMFO60524 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMFO60524 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMFO60524 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMFO60524 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMFO60524 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMFO60524 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEMFO60524 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEMFO60524 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEMFO60524 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEMFO60524 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMFO60524 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMFO60524 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMFO60524 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMFO60524 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMFO60524 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEMFO60524 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEMFO60524 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEMFO60524 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEMFO60524 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMFO60524 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMFO60524 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMFO60524 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMFO60524 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMFO60524 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMFO60524 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMFO60524 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEMFO60524 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEMFO60524 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEMFO60524 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEMFO60524 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEMFO60524 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEMFO60524 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEMFO60524 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEMFO60524 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEMFO60524 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEMFO60524 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEMFO60524 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEMFO60524 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEMFO60524 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEMFO60524 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEMFO60524 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEMFO60524 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEMFO60524 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEMFO60524 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEMFO60524 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEMFO60524 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEMFO60524 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEMFO60524 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEMFO60524 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEMFO60524 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEMFO60524 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEMFO60524 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms