Protein–RNA interactions for Protein: O43173

ST8SIA3, Sia-alpha-2,3-Gal-beta-1,4-GlcNAc-R:alpha 2,8-sialyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST8SIA3O43173 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ST8SIA3O43173 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ST8SIA3O43173 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms