Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC1O15269 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC1O15269 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC1O15269 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms