Protein–RNA interactions for Protein: O15116

LSM1, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM1O15116 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM1O15116 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM1O15116 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM1O15116 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM1O15116 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM1O15116 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM1O15116 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM1O15116 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM1O15116 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM1O15116 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM1O15116 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM1O15116 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM1O15116 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM1O15116 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM1O15116 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM1O15116 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM1O15116 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM1O15116 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM1O15116 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM1O15116 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM1O15116 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM1O15116 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM1O15116 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM1O15116 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM1O15116 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM1O15116 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM1O15116 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM1O15116 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM1O15116 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM1O15116 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM1O15116 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM1O15116 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM1O15116 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM1O15116 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM1O15116 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM1O15116 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM1O15116 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM1O15116 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM1O15116 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM1O15116 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM1O15116 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM1O15116 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM1O15116 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM1O15116 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM1O15116 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM1O15116 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM1O15116 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM1O15116 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM1O15116 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM1O15116 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM1O15116 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM1O15116 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM1O15116 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM1O15116 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM1O15116 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM1O15116 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM1O15116 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM1O15116 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM1O15116 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM1O15116 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM1O15116 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM1O15116 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM1O15116 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM1O15116 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM1O15116 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM1O15116 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM1O15116 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM1O15116 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM1O15116 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM1O15116 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM1O15116 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM1O15116 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM1O15116 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM1O15116 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM1O15116 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM1O15116 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM1O15116 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM1O15116 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM1O15116 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms