Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP290O15078 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP290O15078 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP290O15078 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP290O15078 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP290O15078 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP290O15078 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP290O15078 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP290O15078 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP290O15078 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP290O15078 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP290O15078 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP290O15078 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP290O15078 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP290O15078 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP290O15078 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP290O15078 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP290O15078 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP290O15078 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP290O15078 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP290O15078 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP290O15078 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP290O15078 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP290O15078 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP290O15078 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP290O15078 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP290O15078 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP290O15078 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP290O15078 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP290O15078 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP290O15078 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP290O15078 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP290O15078 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP290O15078 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP290O15078 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP290O15078 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP290O15078 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP290O15078 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP290O15078 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP290O15078 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP290O15078 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms