Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRDMT1O14717 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRDMT1O14717 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDMT1O14717 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms