Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SUPT5HO00267 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SUPT5HO00267 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
SUPT5HO00267 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SUPT5HO00267 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SUPT5HO00267 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
SUPT5HO00267 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms