Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2LH3BP13 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2LH3BP13 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms