Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHMG1C9JSJ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMG1C9JSJ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMG1C9JSJ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms