Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBY3A6NI87 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CBY3A6NI87 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms