Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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