Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YVX5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YVX5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms