Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGHV3-16A0A0C4DH30 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms