Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX5Q9Y5X3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX5Q9Y5X3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX5Q9Y5X3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1733 ms