Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms