Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K8

ATP6V1D, V-type proton ATPase subunit D, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1DQ9Y5K8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V1DQ9Y5K8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V1DQ9Y5K8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP6V1DQ9Y5K8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms