Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB12Q9Y5F1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB12Q9Y5F1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHB12Q9Y5F1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB12Q9Y5F1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB12Q9Y5F1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB12Q9Y5F1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB12Q9Y5F1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB12Q9Y5F1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB12Q9Y5F1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB12Q9Y5F1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB12Q9Y5F1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB12Q9Y5F1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB12Q9Y5F1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms