Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRP12Q9Y561 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LRP12Q9Y561 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRP12Q9Y561 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms