Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC46.73■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC46.71■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC46.71■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC46.69■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC46.67■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC46.67■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC46.66■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC46.64■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
DCAF1Q9Y4B6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC46.6■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC46.59■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.55■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC46.55■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.55■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC46.54■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC46.53■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC46.52■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
DCAF1Q9Y4B6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC46.5■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC46.49■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC46.49■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC46.49■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC46.48■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC46.48■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
DCAF1Q9Y4B6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms