Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR55Q9Y2T6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPR55Q9Y2T6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR55Q9Y2T6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms